冷凍干燥是治療性蛋白質制劑的關鍵工藝。作為蛋白質凍干過程中的保護劑，氨基酸需使蛋白質在凍結及后續(xù)干燥階段所面臨的多種不穩(wěn)定應力下保持穩(wěn)定。

研究表明，氨基酸與蔗糖、海藻糖等常用穩(wěn)定劑具有相似的凍干保護作用，但其化學結構與理化性質更為多樣。氨基酸在液態(tài)和固態(tài)下均能抑制蛋白質聚集，且在冷凍與干燥狀態(tài)下表現(xiàn)出有利的理化特性，有望成為新一代蛋白質凍干保護劑。

相較于冷凍過程，凍干對溶質的特異性要求更為嚴格。蔗糖和海藻糖是目前常用的凍干保護劑，因為凍干過程中的穩(wěn)定需要糖與蛋白質之間發(fā)生直接相互作用。

在小規(guī)模操作中，糖類足以實現(xiàn)蛋白質的干燥；但在大規(guī)模藥物蛋白質凍干中，除糖外還需添加賦形劑，以優(yōu)化凍干工藝并獲得形態(tài)良好的餅狀結構。部分氨基酸即用作此類賦形劑，其中甘氨酸最常見。甘氨酸在凍干過程中發(fā)生結晶，為冰晶升華提供充足空間，從而成功完成凍干并形成外觀合格的餅狀物，但其本身無法為干燥后的蛋白質提供穩(wěn)定性保護。

組氨酸和精氨酸可通過氫鍵（或離子-偶極相互作用）與蛋白質結合，保護抗體免受凍干誘導的結構擾動，從而維持其干燥狀態(tài)下的穩(wěn)定性。研究表明，堿性氨基酸（賴氨酸、精氨酸和組氨酸）在凍干后會發(fā)生玻璃化轉變，表明其至少部分以無定形態(tài)存在；但凍干后的堿性氨基酸并非無定形，仍可檢測到部分晶體衍射峰。配方的pH值是影響組氨酸結晶行為的關鍵因素：在pH 6.0時組氨酸不易結晶，而在較高或較低pH條件下則容易結晶。推測組氨酸分子中帶電與不帶電咪唑基團之間的平衡狀態(tài)可能調控其結晶過程。